市场上的一次性纸杯质量参差不齐，隐患较大。有的广州纸杯厂家为了使杯子看上去更白，加入了荧光增白剂，这种荧光物质可使细胞产生变异，一旦进入人体就会成为潜在的致癌因素。为了使纸杯达到隔水效果，生产中会在内壁涂一层聚乙烯隔水膜，聚乙烯是食物加工中较安全的化学物质，但如果所选用的材料不好，或加工工艺不过关。
聚乙烯是食物加工中比较安全的化学物质，它在水中是很难溶解的，无毒、无味。在聚乙烯热熔或涂抹到纸杯过程中，可能会氧化为羰基化合物，而羰基化合物在常温下不易挥发，但在纸杯倒入热水时，就可能挥发出来，所以人们会闻到怪味。长期摄入这种有机化合物，对健康不利，甚至致癌。
虽然还没有研究证实，纸杯上释放出的羰基化合物究竟会给人体带来怎样的危害，但从一般理论上分析，长期摄入这种有机化合物，对人体一定是有害的。更令人担心的是，有的劣质纸杯采用再生聚乙烯，在再加工过程中会产生裂解变化，产生许多有害化合物，在使用中更易向水中迁移。国家明令禁止再生聚乙烯用于食品包装，但因为再生聚乙烯价格便宜，有些小厂为节省成本，仍违规使用。
纸杯质量的国家标准中，只需要检测微生物，还没有对化学物质的检测，因为这种检测做起来非常复杂，难度很大。有些纸杯由于纸浆质量差，为了让产品白就大量添加荧光漂白剂，这有致癌危险。广州纸杯厂家建议，一次性纸杯不可多用，如用应该装冷水，以减少有害化学物质的挥发。
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