文章来源:检验星空。
荧光PCR方法检测病原体已成为常规检测技术,在工作过程中我们也遇到了各种各样、千奇百怪的问题,下面就我们实验室遇到的一些关于PCR扩增曲线的异常情况及一些经验体会跟大家分享。
2、常见异常结果分析
2.1 案例1
2.1.1现象:常见单基因翘尾且出现较大的Ct值和单基因翘尾无Ct值现象,见下图:
2.3.2常见原因:样本中可能存在干扰物质、提取纯化不完全、PCR仪热盖出现异常等。
2.3.3解决方案:复测;重新提取,或使用不同试剂盒提取。
2.4案例4
2.4.1现象:不规则的扩增曲线(见下图):
2.4.2常见原因:整板其他孔位曲线没有异常情况出现,可能该孔位溶液有气泡影响,气泡可以让光路发生折射,在气泡破掉的时候会导致荧光信号发生急剧的变化,干扰仪器对荧光信号的采集。
2.4.3解决方案: ①加样时减少气泡产生 ;②上机前注意弹掉气泡再离心。
2.5案例5
2.5.1现象:内源性内参曲线异常。
2.5.2常见原因:该孔有异物;温度或荧光信号采集异常;该检测的反应体系中存在抑制物;提取核酸失败;样本采集不合格;样本/核酸漏加。
2.5.3解决方案:打开PCR仪盖,查看孔内是否有异物,假如有异物,用镊子夹出异物,或用洗耳球吹出异物;分析前一批结果中,该孔内标是否扩增,假如连续两次内标无扩增,考虑该孔温度异常或荧光信号采集异常,需要进行校准或报修。排除以上情况后,对原标本复检,若内标正常可以正常发报告;若内标仍然无扩增,则需重新采样复检。
2.6案例6
2.6.1现象:外源性内标曲线异常
外源性加入的内标均一性较好(如G行12孔均有内标曲线,且其CT值均一,见下图)
但工作中有时会发现同一排或同一行中内标比较离散,甚至有多个内标不起(如F行的F7、F9、F10、F11孔均无内标曲线,无CT值,其余各孔CT值比较离散,见下图)
2.6.2常见原因:①排枪与枪头不匹配,结合不严密,导致加样量不足/不均一;②使用排枪吸取内标混合液时,液体堵住了部分枪头滤芯,导致向裂解板加样时加样量不均一,甚至部分孔没有液体加入。
2.6.3解决方案:建议使用配套量程的枪头,移液器要慢放慢吸;分装试剂和加样时仔细观察液体是否打出。
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珠海宝锐生物科技有限公司成立于2012年,专注于核酸断试诊剂核心原料领域,是珠海市独角兽种子企业、广东省专精特新企业、国家高新技术企业。成功研制了多个系列的高品质分子诊断用酶和配套试剂,已得到众多国内知名企业和研究机构的认可,并广泛应用在诊断试剂的研发和生产中。同时,宝锐大力投入mRNA疫苗原料、NGS建库试剂、数字PCR扩增试剂、STR多重检测试剂等多项研究,相关新品陆续上市。